Frac. Seed Seq. with Motif
0.00
1.00
Terminator1
RF01959
A
U
U
C
C
G
G
U
U
G
A
U
C
C
U
G
C
C
G
G
A
G
G
Y
C
A
Y
U
G
C
U
A
U
Y
G
G
R
G
U
Y
C
G
A
Y
U
W
A
G
C
C
A
U
G
C
K
A
G
U
Y
G
H
R
C
G
Y
W
S
Y
U
Y
A
G
R
S
U
G
C
G
Y
G
G
C
R
K
A
Y
D
G
C
U
C
A
G
U
A
A
C
A
C
G
U
G
G
M
Y
A
A
M
C
U
A
C
C
C
U
H
K
G
G
W
S
G
G
G
G
A
U
A
A
C
C
Y
C
G
G
G
A
A
A
C
U
G
R
G
G
M
U
A
A
U
M
C
Y
C
S
A
U
A
G
G
B
S
W
Y
K
M
A
U
S
C
U
G
G
A
A
U
G
S
U
Y
Y
K
W
S
B
Y
Y
G
A
A
A
B
G
Y
U
C
C
G
G
C
G
C
Y
H
U
A
G
G
A
U
G
K
G
K
C
U
G
C
G
G
C
C
K
A
U
Y
A
G
G
U
W
G
W
Y
G
G
U
G
G
G
G
U
A
A
Y
G
G
C
C
C
A
C
C
A
W
G
C
C
K
A
U
R
A
Y
S
G
G
U
A
C
G
G
G
Y
Y
G
U
G
A
G
A
G
C
R
R
G
A
G
C
C
C
G
G
A
G
A
Y
G
G
A
H
W
C
U
G
A
G
A
C
A
A
G
R
D
Y
C
C
R
G
G
C
C
C
U
A
C
G
G
G
G
Y
G
C
A
G
C
A
G
G
C
G
C
G
A
A
A
M
C
U
Y
Y
R
C
A
M
U
G
C
R
C
G
M
A
A
S
Y
G
Y
G
A
Y
R
R
G
G
G
G
A
C
Y
C
C
G
A
G
U
G
C
C
A
K
S
G
Y
A
U
W
W
A
G
Y
S
C
U
S
G
C
U
U
U
U
C
Y
B
M
A
S
Y
S
U
A
A
R
R
A
G
S
U
K
S
D
G
G
A
A
U
A
A
G
G
G
S
U
G
G
G
C
A
A
G
W
C
Y
G
G
U
G
Y
C
A
G
C
C
G
C
C
G
C
G
G
U
A
A
U
A
C
C
R
G
C
A
S
C
Y
C
R
A
G
U
G
R
U
G
G
C
C
R
H
U
W
U
U
A
U
U
G
G
G
C
C
U
A
A
A
G
C
G
U
C
C
G
U
A
G
C
Y
G
G
Y
Y
Y
K
G
Y
A
A
G
U
Y
Y
Y
Y
Y
G
K
K
A
A
A
U
C
Y
A
C
C
M
G
C
U
Y
A
A
C
B
G
K
U
G
G
R
C
K
U
S
C
G
G
S
R
G
A
W
A
C
U
R
Y
Y
W
G
G
C
U
W
G
G
G
R
C
C
G
G
R
A
G
A
S
G
Y
S
R
R
R
G
G
U
A
C
U
Y
C
C
G
G
G
G
U
A
G
G
R
G
U
R
A
A
A
U
C
C
U
G
U
A
A
U
C
C
Y
K
G
R
M
G
G
A
C
C
A
C
C
D
R
U
G
G
C
G
A
A
R
G
C
R
Y
Y
Y
B
R
C
Y
A
G
A
A
C
G
G
R
Y
C
C
G
A
C
G
G
U
G
A
G
G
G
A
C
G
A
A
A
G
C
Y
R
G
G
G
K
M
K
C
R
A
A
C
C
G
G
A
U
U
A
G
A
U
A
C
C
C
G
G
G
U
A
G
U
C
C
Y
R
G
C
Y
G
U
A
A
A
C
G
A
U
G
Y
K
S
R
C
U
W
G
G
U
G
U
K
G
S
R
Y
W
G
G
C
U
W
C
G
A
G
Y
C
U
G
Y
S
C
W
G
U
G
C
C
G
H
A
G
G
G
A
A
G
C
Y
G
U
U
A
A
G
Y
S
M
G
C
C
G
C
C
U
G
G
G
R
A
G
U
A
C
G
K
Y
C
G
C
A
A
G
G
M
U
G
A
A
A
C
U
U
A
A
A
G
G
A
A
U
U
G
G
C
G
G
G
G
G
A
G
C
A
C
Y
A
C
A
A
C
S
G
G
W
G
G
A
G
C
C
U
G
C
G
G
U
U
U
A
A
U
U
G
G
A
Y
U
C
A
A
C
G
C
C
G
G
A
M
A
U
C
U
Y
A
C
C
R
G
S
R
S
C
G
A
C
A
G
Y
A
K
R
A
U
G
A
M
G
G
Y
C
A
G
G
Y
U
R
A
H
G
A
C
Y
U
U
R
C
Y
H
G
A
C
Y
H
G
C
U
G
A
G
A
G
G
W
G
G
U
G
C
A
U
G
G
C
C
G
Y
C
G
U
C
A
G
Y
U
C
G
U
R
C
Y
G
U
G
A
R
G
Y
G
U
C
C
U
G
U
U
A
A
G
U
C
A
G
G
Y
A
A
C
G
A
G
C
G
A
G
A
C
C
C
S
Y
R
Y
Y
Y
Y
Y
A
R
U
U
G
C
Y
A
G
C
A
U
B
W
Y
C
U
Y
Y
G
G
R
W
K
Y
U
G
G
G
Y
A
C
W
Y
U
A
G
G
G
R
G
A
C
Y
G
C
C
R
S
Y
G
C
U
A
A
R
S
Y
G
G
A
G
G
A
A
G
G
A
R
C
G
G
G
C
A
A
C
G
G
Y
A
G
G
U
C
A
G
U
A
U
G
C
C
C
C
G
A
A
W
S
Y
C
C
Y
G
G
G
C
U
A
C
A
C
G
C
G
G
G
C
U
A
C
A
A
U
G
G
Y
Y
R
G
G
A
C
A
A
U
G
G
G
W
U
S
C
D
A
C
C
C
C
G
A
R
A
G
G
G
G
R
M
G
S
U
A
A
U
C
Y
C
Y
U
A
A
A
C
Y
Y
G
G
Y
C
K
U
A
G
U
U
C
G
G
A
U
Y
G
A
G
G
G
C
U
G
H
A
A
C
U
C
G
C
C
C
U
C
R
U
G
A
A
G
C
U
G
G
A
W
U
C
S
S
U
A
G
U
A
A
Y
C
G
C
G
U
K
U
C
A
A
M
A
K
M
G
C
G
C
G
G
U
G
A
A
U
A
C
G
U
C
C
C
U
G
C
U
C
C
U
U
G
C
A
C
A
C
A
C
C
G
C
C
C
G
U
C
A
M
W
C
C
A
Y
C
C
G
A
G
U
K
R
G
G
U
Y
Y
G
G
R
U
G
A
G
G
C
Y
Y
Y
S
U
Y
Y
W
U
W
H
K
G
G
S
R
K
G
G
U
C
G
A
A
Y
Y
U
G
G
G
Y
U
Y
C
G
Y
R
A
G
G
R
G
G
S
W
U
A
A
G
U
C
G
U
A
A
C
A
A
G
G
U
A
G
C
C
G
U
A
G
G
G
G
A
A
Y
C
U
G
C
G
G
C
U
G
G
A
U
C
A
C
C
U
C
C
U
5'
3'