Frac. Seed Seq. with Motif
0.00
1.00
C-loop
RF02543
Y
G
A
C
C
U
C
A
R
A
U
Y
A
G
G
Y
R
R
G
A
Y
U
A
C
C
C
G
C
U
G
A
A
Y
U
U
A
A
G
C
A
U
A
U
Y
A
A
U
A
A
G
C
G
G
A
G
G
A
A
A
A
G
A
A
A
C
U
A
A
C
M
A
G
G
A
U
U
C
C
C
Y
Y
A
G
U
A
A
C
G
G
C
G
A
G
Y
G
A
A
S
M
G
G
G
A
A
R
A
G
C
Y
C
A
M
R
Y
Y
K
A
A
A
M
Y
C
Y
S
S
S
Y
C
C
Y
U
Y
K
G
S
S
K
C
Y
G
R
R
W
U
G
U
R
R
Y
B
U
R
K
A
G
R
R
G
Y
G
U
Y
Y
Y
Y
A
G
Y
K
G
Y
R
G
M
B
C
S
G
G
Y
C
Y
A
A
G
U
Y
C
Y
Y
U
G
G
A
A
Y
R
G
G
R
C
V
Y
C
A
K
A
G
A
G
G
G
U
G
A
S
A
R
B
C
C
Y
G
U
H
Y
G
G
Y
Y
B
S
S
W
G
C
Y
K
C
Y
B
C
U
S
Y
R
Y
G
R
K
G
Y
K
Y
Y
U
Y
C
W
A
M
G
A
G
U
C
G
R
G
U
U
G
Y
U
U
G
G
G
A
R
U
G
C
A
G
C
Y
C
W
A
A
G
U
G
G
G
U
G
G
U
A
A
A
Y
U
Y
C
A
U
C
U
A
A
R
G
C
U
A
A
A
U
A
Y
U
R
S
C
R
M
G
A
G
A
C
C
G
A
U
A
G
C
R
A
A
C
A
A
G
U
A
C
C
G
U
G
A
G
G
G
A
A
A
G
W
U
G
A
A
A
A
G
M
A
C
U
Y
U
G
A
A
A
A
G
A
G
A
G
U
U
M
A
A
K
A
G
U
A
C
S
U
G
A
A
A
Y
Y
G
Y
U
R
A
R
A
G
G
G
A
A
R
C
G
R
W
U
G
R
R
R
Y
Y
A
G
H
V
U
H
U
B
Y
K
C
Y
C
B
G
K
R
R
W
W
U
U
M
S
Y
C
W
K
Y
G
B
B
Y
U
Y
H
B
S
U
B
S
K
K
K
B
Y
K
Y
M
Y
Y
Y
Y
C
Y
Y
S
K
U
K
S
S
K
D
R
S
C
A
G
S
V
U
Y
R
G
U
Y
Y
Y
B
S
B
S
G
K
Y
S
G
M
Y
W
A
A
V
S
Y
C
Y
K
U
V
K
R
W
K
U
K
G
Y
G
B
B
Y
Y
S
Y
K
K
S
H
G
Y
K
Y
Y
Y
B
W
Y
S
K
B
Y
D
K
U
K
K
B
Y
K
U
K
M
Y
K
S
Y
K
K
K
H
U
Y
R
Y
Y
S
Y
U
K
R
K
Y
B
B
G
B
G
C
U
U
Y
G
S
C
C
Y
M
B
Y
Y
Y
Y
M
U
K
Y
S
M
G
G
A
B
S
Y
U
G
R
C
R
W
A
A
U
G
G
Y
Y
Y
Y
A
W
C
Y
G
A
C
C
C
G
U
C
U
U
G
A
A
A
C
A
C
G
G
A
C
C
A
A
G
G
A
G
U
C
U
A
A
C
A
U
R
Y
R
Y
G
C
R
A
G
U
S
W
U
Y
G
G
G
U
G
D
K
Y
A
A
A
C
C
Y
A
W
A
B
G
C
G
Y
A
A
U
G
A
A
A
G
U
R
A
A
Y
Y
R
A
G
G
U
R
G
G
A
U
C
Y
Y
B
B
W
M
H
U
G
G
G
Y
G
C
A
C
Y
A
Y
C
G
R
C
C
G
R
Y
C
Y
Y
G
A
Y
Y
U
Y
Y
U
S
A
G
A
R
R
G
R
U
Y
Y
G
A
G
Y
W
W
G
A
G
C
R
U
R
Y
M
U
G
U
U
R
G
G
A
C
C
C
G
A
A
A
G
A
U
G
G
U
G
A
A
C
U
A
U
G
C
C
U
G
A
R
Y
A
G
G
G
Y
G
A
A
G
Y
C
A
G
R
G
G
A
A
A
C
U
C
U
G
R
U
G
G
A
R
G
Y
Y
C
G
U
A
G
C
G
R
U
U
C
U
G
A
C
G
U
G
C
A
A
A
U
C
G
A
U
C
G
U
C
A
R
A
Y
Y
U
G
G
G
U
A
U
A
G
G
G
G
C
G
A
A
A
G
A
C
U
A
A
U
C
G
A
A
C
C
A
U
C
U
A
G
U
A
G
C
U
G
G
U
U
C
C
Y
U
C
C
G
A
A
G
U
U
U
C
C
C
U
C
A
G
G
A
U
A
G
C
W
G
G
A
R
Y
U
B
Y
W
W
W
K
Y
A
G
U
U
U
U
A
U
C
A
G
G
U
A
A
A
G
C
G
A
A
U
G
A
U
U
A
G
A
G
G
C
Y
U
Y
G
G
G
G
A
C
G
A
A
A
Y
G
W
C
C
U
Y
R
A
C
C
U
A
U
U
C
U
C
A
A
A
C
U
U
U
A
A
A
U
R
K
G
U
A
A
G
A
A
S
Y
C
C
K
K
S
U
U
R
C
U
U
A
A
U
U
G
A
A
S
Y
Y
K
G
R
C
R
Y
U
G
A
A
U
R
G
A
G
A
G
Y
U
C
Y
W
A
G
U
G
G
G
C
C
A
U
U
U
U
U
G
G
U
A
A
G
C
A
G
A
A
C
U
G
G
C
G
M
U
G
Y
G
G
G
A
U
G
A
A
C
C
G
A
A
C
G
Y
Y
G
R
G
U
U
A
A
G
G
Y
G
C
C
H
R
A
M
U
R
C
W
C
G
C
U
C
A
U
C
K
A
G
A
Y
M
C
C
A
Y
A
A
A
A
G
G
U
G
U
U
R
G
U
U
S
A
U
H
U
A
G
A
C
A
G
C
A
G
G
A
C
G
G
U
G
G
Y
C
A
U
G
G
A
A
G
U
C
G
R
A
A
U
C
C
G
C
U
A
A
G
G
A
G
U
G
U
G
U
A
A
C
A
A
C
U
C
A
C
C
U
G
C
C
G
A
A
U
S
A
A
C
U
A
G
C
C
C
U
G
A
A
A
A
U
G
G
A
U
G
G
C
G
C
U
B
A
A
G
C
G
U
G
Y
K
R
C
C
B
A
U
A
C
Y
Y
S
R
C
C
R
U
Y
R
G
G
G
Y
A
R
R
U
K
Y
K
W
U
G
Y
Y
Y
Y
R
A
Y
G
A
G
U
A
G
G
M
R
G
G
C
G
Y
G
G
M
G
G
U
U
G
Y
G
W
Y
G
A
A
G
C
Y
Y
U
G
G
G
C
G
U
R
A
G
C
C
Y
G
S
G
U
G
G
A
R
C
R
G
C
C
U
Y
U
A
G
U
G
C
A
G
A
U
C
U
U
G
G
U
G
G
U
A
G
U
A
G
C
A
A
A
U
A
U
U
C
A
A
R
U
G
A
G
A
A
C
Y
U
U
G
A
R
G
A
C
Y
G
A
A
G
U
G
G
A
G
A
A
R
G
G
U
U
C
C
R
Y
G
U
G
A
A
C
A
G
Y
A
R
U
U
G
R
A
C
A
Y
G
G
G
U
Y
A
G
Y
C
G
R
U
C
C
U
A
A
G
V
G
A
Y
A
G
G
G
D
A
R
H
U
C
Y
G
U
U
U
C
A
A
A
G
G
G
G
B
S
C
U
Y
U
K
U
C
Y
C
Y
G
Y
Y
U
M
Y
C
G
A
A
A
G
G
G
A
A
U
C
S
G
G
U
U
A
A
U
A
U
U
C
C
Y
G
A
A
C
C
W
G
G
A
Y
G
Y
G
G
A
U
U
H
U
R
Y
R
Y
G
G
Y
A
A
C
R
Y
A
A
M
Y
G
A
A
C
U
Y
G
G
A
G
A
C
G
Y
Y
G
G
C
R
G
G
R
G
C
C
C
Y
G
G
G
A
A
G
A
G
U
U
Y
U
C
U
U
U
U
C
U
U
Y
U
U
A
A
C
R
G
Y
C
Y
R
W
C
C
A
C
C
C
U
G
G
A
A
U
Y
R
G
U
U
Y
R
Y
C
Y
G
G
A
G
A
U
A
G
G
G
U
U
K
M
A
Y
G
R
Y
Y
S
G
W
A
R
A
G
C
A
Y
C
G
Y
R
Y
Y
U
Y
Y
Y
G
Y
G
G
Y
G
U
C
Y
G
G
U
G
Y
G
C
U
C
Y
Y
G
A
Y
G
R
Y
C
C
U
U
G
A
A
A
A
U
C
C
R
A
G
G
G
A
R
R
G
A
W
U
W
W
W
U
Y
U
C
A
C
S
C
C
W
G
G
Y
C
G
U
A
C
Y
C
A
U
A
W
C
C
G
C
A
K
C
A
G
G
U
C
U
C
C
A
A
G
G
U
K
A
R
C
A
G
C
C
U
C
U
R
G
U
Y
G
A
U
A
G
A
A
Y
A
A
U
G
U
A
G
R
U
A
A
G
G
G
A
A
G
U
C
G
G
C
A
A
A
W
U
A
G
A
U
C
C
G
U
A
A
C
U
U
C
G
G
G
A
W
A
A
G
G
A
U
U
G
G
C
U
C
U
R
A
G
G
G
Y
Y
G
G
G
Y
M
B
R
U
B
G
G
G
C
Y
U
K
R
K
Y
B
K
G
A
A
G
Y
K
K
K
S
S
B
B
S
G
K
S
S
Y
D
G
G
H
S
K
S
C
G
B
K
W
G
S
Y
S
S
K
Y
A
M
S
B
G
K
B
G
R
S
Y
G
B
S
B
U
C
Y
Y
S
B
K
Y
S
B
G
S
S
Y
B
Y
Y
B
G
U
G
R
A
Y
S
Y
Y
Y
Y
G
G
C
W
B
B
S
Y
S
S
Y
Y
Y
S
S
K
B
Y
Y
U
Y
Y
S
S
Y
S
B
R
C
R
W
U
K
A
A
C
A
R
Y
Y
A
A
C
U
Y
A
G
A
A
C
U
G
G
Y
R
C
G
G
A
C
A
A
G
G
G
G
A
A
U
C
C
G
A
C
U
G
U
Y
U
A
A
U
U
A
A
A
A
C
A
W
A
G
C
A
U
U
G
Y
G
A
U
G
G
Y
C
M
S
A
A
M
S
B
G
G
U
G
U
U
G
A
C
R
C
A
A
U
G
U
G
A
U
U
U
C
U
G
C
C
C
A
G
U
G
C
U
C
U
G
A
A
U
G
U
C
A
A
A
G
U
G
A
A
G
A
A
A
U
U
C
A
A
C
C
A
A
G
C
G
C
G
G
G
U
A
A
A
C
G
G
C
G
G
G
A
G
U
A
A
C
U
A
U
G
A
C
U
C
U
C
U
U
A
A
G
G
U
A
G
C
C
A
A
A
U
G
C
C
U
C
G
U
C
A
U
C
U
A
A
U
U
A
G
U
G
A
C
G
C
G
C
A
U
G
A
A
U
G
G
A
U
U
A
A
C
G
A
G
A
U
U
C
C
C
A
C
U
G
U
C
C
C
U
A
U
C
U
A
C
U
A
U
C
U
A
G
C
G
A
A
A
C
C
A
C
A
G
C
C
A
A
G
G
G
A
A
C
G
G
G
C
U
U
G
G
M
A
R
A
A
U
C
A
G
C
G
G
G
G
A
A
A
G
A
A
G
A
C
C
C
U
G
U
U
G
A
G
C
U
U
G
A
C
U
C
U
A
G
U
Y
Y
G
R
C
W
U
U
G
U
G
A
A
R
H
G
A
C
W
U
R
R
G
R
G
G
U
G
U
A
G
M
A
U
A
R
G
U
G
G
G
A
G
C
Y
U
Y
Y
R
G
G
C
G
M
C
R
G
U
G
A
A
A
U
A
C
C
A
C
U
A
C
Y
Y
U
Y
A
W
Y
G
U
Y
K
Y
U
U
U
A
C
U
U
A
Y
U
Y
V
R
U
K
A
R
G
Y
G
G
A
R
M
Y
Y
G
R
S
Y
Y
Y
H
K
S
G
S
Y
C
Y
W
M
Y
U
U
Y
U
D
G
Y
U
Y
Y
A
A
G
S
Y
Y
S
Y
Y
U
Y
K
Y
S
G
G
S
Y
G
A
Y
C
Y
R
S
G
Y
B
G
A
A
G
A
C
A
U
U
G
Y
C
A
G
G
Y
G
G
G
G
A
G
U
U
U
G
R
C
U
G
G
G
G
C
G
G
Y
A
C
A
U
C
U
G
U
Y
A
A
A
C
R
A
U
A
A
C
G
C
A
G
G
U
G
U
C
C
U
A
A
G
G
Y
G
A
G
C
U
C
A
R
Y
G
A
G
R
A
C
A
G
A
A
A
Y
C
U
C
R
Y
G
U
A
G
A
V
Y
A
A
A
A
G
G
G
Y
A
A
A
A
G
C
U
C
V
C
U
U
G
A
U
Y
U
U
G
A
U
U
U
U
C
A
G
U
A
Y
G
A
A
U
A
C
A
R
A
C
Y
G
Y
G
A
A
A
G
C
R
U
G
G
C
C
U
A
U
C
G
A
U
C
C
U
U
U
W
G
D
Y
Y
Y
U
C
R
R
A
R
U
U
U
K
M
R
G
C
W
A
G
A
G
G
U
G
Y
C
A
G
A
A
A
A
G
U
U
A
C
C
A
C
A
G
G
G
A
U
A
A
C
U
G
G
C
U
U
G
U
G
G
C
A
G
C
C
A
A
G
C
G
U
U
C
A
U
A
G
C
G
A
C
G
U
U
G
C
U
U
U
U
U
G
A
U
C
C
U
U
C
G
A
U
G
U
C
G
G
C
U
C
U
U
C
C
U
A
U
C
A
U
U
S
Y
G
A
A
G
C
A
G
A
A
U
U
C
R
C
M
A
A
G
Y
G
U
Y
G
G
A
U
U
G
U
U
C
A
C
C
C
R
C
Y
A
A
U
A
G
G
G
A
A
C
G
U
G
A
G
C
U
G
G
G
U
U
U
A
G
A
C
C
G
U
C
G
U
G
A
G
A
C
A
G
G
U
U
A
G
U
U
U
U
A
C
C
C
U
A
C
U
G
A
U
G
A
M
W
Y
G
U
Y
G
U
Y
G
Y
R
A
Y
A
G
U
A
A
U
Y
C
W
R
C
U
Y
A
G
U
A
C
G
A
G
A
G
G
A
A
C
C
G
Y
U
G
R
U
U
C
R
G
A
Y
A
W
U
U
G
G
U
W
Y
W
U
G
C
R
S
Y
U
G
K
Y
Y
G
A
M
M
R
G
C
Y
A
R
U
G
S
Y
G
C
G
A
A
G
C
U
A
C
C
A
U
C
Y
G
Y
U
G
G
A
U
U
A
U
G
R
C
U
G
A
A
C
G
C
C
U
C
U
A
A
G
Y
C
A
G
A
A
U
C
C
A
U
S
C
U
R
G
W
A
A
G
C
R
A
Y
R
A
U
U
U
Y
U
K
Y
B
Y
Y
B
Y
S
K
U
U
K
U
Y
R
G
A
U
G
R
A
H
M
H
G
A
A
W
A
K
G
S
Y
B
Y
Y
Y
K
K
G
C
C
C
Y
K
C
A
B
Y
M
S
Y
V
Y
M
K
Y
H
C
U
R
B
G
K
M
K
K
S
B
Y
Y
Y
Y
S
Y
Y
S
G
C
Y
M
R
A
A
R
S
Y
Y
C
Y
B
B
B
Y
S
Y
Y
H
R
Y
C
S
C
B
A
A
W
Y
W
Y
H
A
W
U
K
Y
A
M
A
H
H
Y
U
S
R
V
R
G
B
G
H
U
A
A
A
U
C
C
Y
Y
U
G
Y
A
G
A
C
G
A
C
U
U
R
R
W
U
R
Y
G
S
R
W
C
S
G
G
G
U
R
Y
U
G
U
A
M
G
Y
R
G
U
A
G
A
G
Y
A
G
C
C
U
U
B
U
U
G
Y
U
R
C
G
A
U
C
Y
R
Y
U
G
A
G
R
Y
U
Y
A
K
C
C
Y
U
Y
G
U
Y
Y
B
B
W
M
G
A
U
U
U
G
U
5'
3'