# STOCKHOLM 1.0
#=GF ID Plastid-psbA-2
#=GF AC RF04343
#=GF DE Plastid-psbA-2 3UTR RNA
#=GF AU Hua J; 0000-0003-0669-5192
#=GF GA 55.8
#=GF NC 55.6
#=GF TC 55.8
#=GF SE Mehta D
#=GF SS Predicted; LocARNA;
#=GF TP Cis-reg;
#=GF BM cmbuild -F CM SEED
#=GF CB cmcalibrate --mpi CM
#=GF SM cmsearch --cpu 4 --verbose --nohmmonly -T 30.00 -Z 2958934 CM SEQDB
#=GF CL CL00153
#=GF DR SO; 0001055; transcriptional_cis_regulatory_region;
#=GF RN [1]
#=GF RM 36575799
#=GF RT Retrograde signaling in plants: A critical review focusing on the GUN
#=GF RT pathway and  beyond.
#=GF RA Richter AS, Nagele T, Grimm B, Kaufmann K, Schroda M, Leister D, Kleine T
#=GF RL Plant Commun. 2023;4:100511.
#=GF CC Plastid psbA-2 is a non-coding RNA (ncRNA) present in plastids. It was
#=GF CC identified in inverted repeat sequences in the 3 prime untranslate region
#=GF CC (3UTR) of photosystem II quinone-binding protein (psbA) [1].
#=GF WK Chloroplast_DNA
#=GF SQ 121

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NC_040121.1/151645-151581 -ACAUAAGGAGCAAUAAACCCUCU-UU--UGAUAG--AACA----A--GUAAA---G--G--G---U--U--UAUUGCUCCUUUAUUUUCU
NC_037247.1/410-346       AAUAUAAGGAGCAAGAAACCCUUU-UU--UGAUAA--AACA----A--GA-AA---G--G--G---U--U--UCUUGCUCCUUUAUUUUCU
NC_036082.1/384-324       --UAAAAGGAGCAAUAACCCCUUU-CU--UGGUCU--AUCA----A--G---A---G--G--G--CG--U--UAUUGUUCCCUCUUUUUC-
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